活血，主冶因血热引发的流血，如鼻衄、呕血及女性月经崩漏等症，常搭配生地黄、茅根、犀角等服食。

强宁心安神：川莲芯所含黄酮具备明显的清脑功效,莲芯碱则有较强抗钙及抗心率不齐的功效。

能显著抑止血小板的集聚，降低血栓的形成，并具备抗脂质过氧化及降低胆固醇的功效。这就怪不得，川莲对内分泌系统具备极强的特异性，并且善于净心祛火，除烦解暑，特别是在合适心脑血管病人于夏天服用。

涩精，主冶因肾虚引发的滑泄频繁遗精等症，搭配桑螵蛸、沙苑子、桑椹子等服食。

根状茎作为中药材时有祛火祛毒，清热解毒化湿作用，能冶疗经行热毒、高烧心烦、泄泻痢疾、口腔溃疡、痈疽疔毒等症。药理学实验证实，有抗菌及抗病毒治疗、抗原体虫功效，并能减少血压，扩大冠脉。黄芩含小檗碱、黄芩碱等多种多样黄酮，另含黄柏酮、黄柏内酯等成份。

同为中还有三角叶黄芩，别名雅连、峨媚连，主产区于四川；云南黄连别名云连，主产区于云南省。其根状茎也供药用价值。